Принципы высокого профессионализма в сочетании с чутким отношением к пациентам в госпитале были заложены изначально - с 1919 года, когда в разгар Гражданской войны при полевом штабе РККА в Серпухове был создан госпиталь Красного Креста на 50 коек. Основная часть поступавших тогда больных были «инфекционные»: население молодой советской республики буквально выкашивал тиф.

В тяжелейших условиях работали назначенные с 1 ноября 1919 года старший врач А.М. Архипов и военком М.С. Курин. А.М. Архипов оказывал больным хирургическую помощь, вел амбулаторный прием практически в полевых условиях. Однако уже через год медицинский персонал был значительно увеличен. Двадцать специалистов Красного Креста перешли в подчинение Наркомата обороны и начали работать в госпитале. К тому времени его переименовали в 396-й полевой запасной, где имелось уже 210 коек.

Основное здание отремонтировали. Были развернуты хирургическое и гинекологическое отделения, операционная, перевязочная, лаборатория и рентгеновский кабинет. В мансарде деревянного одноэтажного здания госпиталя разместили общежитие для медперсонала.

В расширенном госпитале с 1919 по 1921 год прошли лечение около семи тысяч больных и раненых, среди них герой Гражданской войны И.С. Кудяков. В 1921 году прибыли новые хирурги, в том числе профессор А.В. Мартынов - первый постоянный консультант, крупнейший советский специалист того времени, проработавший в госпитале до конца своей жизни.

В том же году госпиталь переименовали в Московский госпиталь № 5 штаба РККА.

Вообще судьба этого замечательного госпиталя складывалась так, что переименовывали его часто. Зато его главная общевойсковая задача оставалась неизменной - лечение руководящего состава Вооруженных Сил страны.